拜仁和皇马在冠军杯和冠军联赛中的淘汰赛就交手过七次。拜仁三次胜出，最近的一次是2000-2001赛季，拜仁客场1比0，主场2比1淘汰对手晋级决赛。并且在米兰成功加冕。每次拜仁淘汰皇马之后都能进入当年的决赛。（1976年，1987年，2001年。）拜仁对皇马主客场最辉煌的胜利都出现在1999-2000赛季，在第二阶段小组赛里，拜仁客场4比2痛击对手，建功的分别是绍尔，埃芬博格，芬克和塞尔吉奥。在主场则是拜仁4比1大胜对手，四个进球来自绍尔、埃尔伯以及齐格勒的独中两元。两支球队在之后的半决赛里又一次碰面，皇马主场2比0胜出，拜仁则在主场2比1取胜。拜仁在冠军杯/冠军联赛与皇马的交手记录：全部：16战9胜2平5负，进26球失19球。主场：8战7胜1平0负，进20球失8球。客场：8战2胜1平5负，进6球失11球。拜仁和皇马完全交战记录：时间－比赛阶段－结果31.03.1976 半决赛 皇马 1-1 拜仁 14.04.1976 半决赛 拜仁 2-0 皇马 08.04.1987 半决赛 拜仁 4-1 皇马 22.04.1987 半决赛 皇马 1-0 拜仁 02.03.1988 四分之一决赛 拜仁 3-2 皇马 16.03.1988 四分之一决赛 皇马 2-0 拜仁 29.02.2000 第二阶段小组赛 皇马 2-4 拜仁 08.03.2000 第二阶段小组赛 拜仁 4-1 皇马 03.05.2000 半决赛 皇马 2-0 拜仁 09.05.2000 半决赛 拜仁 2-1 皇马 01.05.2001 半决赛 皇马 0-1 拜仁 09.05.2001 半决赛 拜仁 2-1 皇马 02.04.2002 四分之一决赛 拜仁 2-1 皇马 10.04.2002 四分之一决赛 皇马 2-0 拜仁 24.02.2004 淘汰赛第一轮 拜仁 1-1 皇马 10.03.2004 淘汰赛第一轮 皇马 1-0 拜仁

两支球队没有在欧冠决赛上相遇过。 在欧冠历史上，两队共交锋20次，皇马7胜2平11负居于下风，得失球为26比33。在客场对阵拜仁时，皇马1平9负从没赢过球，得失球为10比24。皇马唯一一次在客战拜仁时没输球，发生在2003/2004赛季，当时银河战舰客场1比1逼平了拜仁。皇马和拜仁这22场比赛，只有两场发生在小组赛中，另外则是11次双回合淘汰赛。在这11次淘汰赛中，皇马晋级5次出局5次，其中5次半决赛皇马晋级2次。 在2006/2007赛季欧冠1/8决赛中，皇马虽然主场3比2首回合获胜，但次回合客场1比2落败，拜仁凭借客场进球多的优势晋级。在2011/2012赛季欧冠半决赛中，两队都在各自主场2比1获胜。在伯纳乌的点球大战中，C罗、卡卡、拉莫斯等人先后射失点球，跪倒在场边的穆里尼奥只能眼看着皇马出局。2013-14赛季欧冠联赛半决赛次回合，皇家马德里做客安联球场4比0击败拜仁慕尼黑 ，总比分5比0淘汰对手，时隔12年之后再度杀入决赛。
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皇马两回合3-3战平拜仁，双方都有1个客场进球，第一回合慕尼黑安联球场里贝里17分钟进了一个球，53分钟厄齐尔进了一个球，89分钟戈麦斯绝杀！1-2皇马落后，第2回合伯纳乌第6分钟c罗进了一个点球，14分钟c罗有进一球，25分钟罗本点球命中，2-1，总比分3-3，加时赛0-0，点球拜仁3-1赢了！进军慕尼黑

球迷对于2001-2002赛季的经历更是难忘。在德国杯第二轮，球队就被业余队马格德堡淘汰。但在联赛最后一轮，凭借帕特里克·安德森在补时阶段最后时刻的间接任意球战胜汉堡队，再次夺得德甲冠军。沙尔克04队的球迷也在这一时刻经历了从大喜到大悲的过程。 在这一年的欧洲冠军联赛赛场上，拜仁慕尼黑队完成了一系列复仇战。先是在四分之一决赛上淘汰了曼彻斯特联队。半决赛两回合分别以1比0和2比1战胜了皇家马德里。2001年5月23日，拜仁慕尼黑队圣西罗球场迎来了决赛对手瓦伦西亚队。卡恩成了当晚的英雄，在120分钟内两队战成1比1平。在随后的点球大战中，卡恩扑出了3个点球，帮助球队第四次举起了欧洲冠军杯。 在随后的2001－2002赛季中，拜仁慕尼黑队仅取得了一项冠军。在联赛冠军的争夺战中，球队排在多特蒙德和勒沃库森队后。在德国杯半决赛上，拜仁慕尼黑队又以0比2输给了沙尔克04队。欧洲赛场上，他们又被老对手皇家马德里队挡在了四强之外。唯一安慰球迷的就是丰田杯赛场上战胜了博卡青年队，库福尔的进球让球队本赛季不至于一无所获。
2000-01赛季欧冠 1/4决赛.拜仁总比分3-1曼联.(客场1-0,主场2-1)半决赛.拜仁总比分3-1皇马.(客场1-0,主场2-1) 决赛.拜仁1-1瓦伦西亚.点球5-4
半决赛还是4分之一决赛是对曼联,决赛是点球战胜瓦伦西亚...... 没查资料,全凭印象= =
恩

主场3-1领先的情况下 88分钟范博梅尔远射帮拜仁追成3-2也拿下2个客场进球 客场回来 开场10秒马凯闪电破门一下大乱了皇马的部署 这场比赛拜仁2-1取胜 总比分4-4凭借客场进球多淘汰皇马 这就是过程
首回合3比2 次回合本来有机会的 但开场卡洛斯一个失误，被萨里哈米基奇断球传中马凯射门得分，创造了欧冠最快进球纪录好像是11秒吧，因为这个失球影响了皇马的士气，最终客场没有守平1比2告负
罗伯特卡洛斯开场低级失误，导致马凯打进欧冠历史最快进球。而且比赛快结束时候又被绝杀了 卡洛斯成了替罪羊，被甩卖了。
主场3:2胜拜仁 客场1:2负于拜仁 客场进球少被淘汰
卡洛斯低级失误马凯闪电进球